实行对外开放，重视国际交流，亦是京都大学在国际上知名度不断提高的一个重要原因。京都大学每年要派出近百名研究生出国学习。至于教员出国研究、调查、讲学、参加国际会议等活动则更多，每年超过1500人次。学校鼓励以个人、系、专业、研究等多种形式对外交流和开展合作，包括邀请国外学者携带课题来京大进行长期或短期合作研究。到1990年5月止，京都大学已接收来自世界55个国家和地区的764名留学生、600名访问学者和研究人员，并同中国的复旦大学、西北大学、武汉大学、北京大学等校签订了校际交流协议。
亚洲
中国
西北大学
武汉大学
北京大学
清华大学
复旦大学
浙江大学
中国科学技术大学
香港科技大学
南京大学
上海交通大学
西安交通大学
印尼 印尼国立科学院
印度尼西亚大学
韩国 庆北大学
首尔大学
延世大学
高丽大学
韩国科学技术院
浦项工科大学
老挝 老挝国立大学
马来西亚 马来亚大学
新加坡 新加坡国立大学
泰国 泰国国立法政大学
朱拉隆功大学
越南 河内国家大学
顺化大学
河内工科大学
台湾 国立台湾大学
国立清华大学
北美 加拿大
多伦多大学
麦吉尔大学
魁北克州大学学长校长协议会
美国 史丹福大学
加利福尼亚大学
布朗大学
乔治华盛顿大学
宾夕法尼亚大学
夏威夷大学
密歇根大学
欧洲 奥地利 维也纳大学
比利时 天主教鲁汶大学
法国 巴黎第七大学
斯特拉斯堡大学
巴黎高等师范学校
德国 柏林自由大学
慕尼黑大学
波恩大学
海德堡大学
慕尼黑工业大学
意大利 博罗尼亚大学
比萨大学
荷兰 莱顿大学
乌特勒支大学
瑞典 乌普萨拉大学
斯德哥尔摩大学
瑞士 瑞士联邦理工(ETH)
洛桑大学
英国 牛津大学
剑桥大学
诺丁汉大学
爱丁堡大学
谢菲尔德大学
曼切斯特大学
俄罗斯 莫斯科国立大学
大洋洲 澳大利亚 昆士兰大学
墨尔本大学
新南威尔士大学
悉尼大学
澳洲国立大学
新西兰 奥克兰大学
东京大学
九州大学
北海道大学
名古屋大学
神户大学
筑波大学
岐阜大学
宫崎大学
香川大学